No, los Edificios no pueden ser destruidos. Sólo perderás Tripulación y Recursos si fracasas en defender tu Guarida. Cuanto más fuerte sea la fuerza del enemigo, más Unidades y Recursos perderás al ser derrotado – pero baja ninguna circunstancia perderás un Edificio. Puedes recolocar cualquier Mejora o Edificio en tu Guarida, pero lo único que puedes destruir de manera permanente son las Fortificaciones y las Mejoras (para hacer sitio a otras de más Nivel).